Uno de los principios del cooperativismo es el control democrático de los asociados. Cada dos años hay elecciones democráticas en la Cooperativa JEP, en la cual se eligen 40 representantes principales y 40 suplentes que forman la Asamblea General, de ellos se elije democráticamente a los miembros del Consejo de Administración que están integrados por cinco vocales principales (ver foto) y cinco vocales suplentes, los cuales están en funciones dos años.

Entre las funciones que realiza el Consejo de Administración están: conocer los informes que presenta Gerencia General sobre la situación financiera de la Cooperativa, el diagnostico de riesgos y su impacto en el patrimonio, el cumplimiento del plan estratégico, plasmando de esta forma el control y la capacidad de decision dentro de la Institución.